Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CttnQ60598 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CttnQ60598 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms