Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf123Q5XPI3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms