Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa4Q5U4H9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa4Q5U4H9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa4Q5U4H9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa4Q5U4H9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa4Q5U4H9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa4Q5U4H9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ncoa4Q5U4H9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms