Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms