Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdcp1Q5U462 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms