Protein–RNA interactions for Protein: Q5U430

Ubr3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3Q5U430 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubr3Q5U430 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubr3Q5U430 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms