Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan4Q5SZT6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zkscan4Q5SZT6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms