Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tsr1Q5SWD9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms