Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms