Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms