Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps54Q5SPW0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps54Q5SPW0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms