Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5431Q5NCB3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5431Q5NCB3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms