Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3kQ5GIG6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3kQ5GIG6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms