Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SynaQ5G5D5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms