Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms