Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chsy3Q5DTK1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms