Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndufaf2Q59J78 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf2Q59J78 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf2Q59J78 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf2Q59J78 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf2Q59J78 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf2Q59J78 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf2Q59J78 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf2Q59J78 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf2Q59J78 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf2Q59J78 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf2Q59J78 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufaf2Q59J78 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms