Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms