Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf608Q56A10 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Znf608Q56A10 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms