Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Eme2Q56A04 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms