Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccnl1Q52KE7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms