Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC17

Adamts18, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts18Q4VC17 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms