Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc3lQ4KL14 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms