Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd5Q3V1H9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms