Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ulk4Q3V129 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms