Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc27Q3V036 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms