Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrfip1Q3UZ39 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrfip1Q3UZ39 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms