Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clpsl2Q3UW21 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms