Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chpf2Q3UU43 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chpf2Q3UU43 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms