Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Shisa3Q3UPR0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms