Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam198bQ3UPI1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam198bQ3UPI1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam198bQ3UPI1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam198bQ3UPI1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam198bQ3UPI1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam198bQ3UPI1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam198bQ3UPI1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam198bQ3UPI1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam198bQ3UPI1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam198bQ3UPI1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam198bQ3UPI1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam198bQ3UPI1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms