Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms