Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms