Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ell2Q3UKU1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ell2Q3UKU1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ell2Q3UKU1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ell2Q3UKU1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ell2Q3UKU1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ell2Q3UKU1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ell2Q3UKU1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms