Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc61Q3UJV1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms