Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm648Q3UJ22 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm648Q3UJ22 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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