Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed8Q3UHI4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed8Q3UHI4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms