Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx27Q3UHD6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms