Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6cQ3UHC0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms