Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plxnd1Q3UH93 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plxnd1Q3UH93 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms