Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frmd8Q3UFK8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd8Q3UFK8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd8Q3UFK8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms