Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms