Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf166Q3U9F6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf166Q3U9F6 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms