Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U6N9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U6N9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U6N9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3U6N9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3U6N9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3U6N9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3U6N9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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