Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U595 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U595 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U595 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U595 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U595 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U595 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U595 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U595 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U595 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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