Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hace1Q3U0D9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms