Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTL0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3TTL0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTL0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTL0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTL0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTL0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTL0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms