Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Calr4Q3TQS0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms