Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms