Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms